9593 CDS's (5294320 codens)
frequency: per thousand
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uniBac

昆蟲細胞密碼子使用頻率統計

發表時間:2023-05-12 10:55
Spodoptera frugiperda
9593 CDS's (5294320 codens)
frequency: per thousand
  |  T      |  C      |  A      |  G      |
--+---------+---------+---------+---------+--
T | TTT F 13| TCT S 13| TAT Y 12| TGT C  9| T
T | TTC F 21| TCC S 11| TAC Y 19| TGC C 10| C
T | TTA L 14| TCA S 13| TAA *  0| TGA *  0| A
T | TTG L 16| TCG S 10| TAG *  0| TGG W 11| G
--+---------+---------+---------+---------+--
C | CTT L  9| CCT P 15| CAT H 11| CGT R  6| T
C | CTC L 13| CCC P 11| CAC H 13| CGC R 11| C
C | CTA L 11| CCA P 16| CAA Q 19| CGA R  7| A
C | CTG L 23| CCG P 12| CAG Q 19| CGG R  6| G
--+---------+---------+---------+---------+--
A | ATT I 16| ACT T 17| AAT N 22| AGT S 13| T
A | ATC I 17| ACC T 12| AAC N 24| AGC S 12| C
A | ATA I 18| ACA T 16| AAA K 33| AGA R 13| A
A | ATG M 22| ACG T 12| AAG K 29| AGG R 10| G
--+---------+---------+---------+---------+--
G | GTT V 13| GCT A 20| GAT D 26| GGT G 14| T
G | GTC V 14| GCC A 17| GAC D 29| GGC G 17| C
G | GTA V 13| GCA A 15| GAA E 35| GGA G 15| A
G | GTG V 23| GCG A 17| GAG E 29| GGG G  7| G
--+---------+---------+---------+---------+--


Trichoplusia ni
8413 CDS's (4545090 codens)
frequency: per thousand
  |  T      |  C      |  A      |  G      |
--+---------+---------+---------+---------+--
T | TTT F 14| TCT S 13| TAT Y 12| TGT C  8| T
T | TTC F 21| TCC S 11| TAC Y 19| TGC C 10| C
T | TTA L 15| TCA S 13| TAA *  0| TGA *  0| A
T | TTG L 15| TCG S 11| TAG *  0| TGG W 10| G
--+---------+---------+---------+---------+--
C | CTT L 10| CCT P 13| CAT H 10| CGT R  6| T
C | CTC L 14| CCC P 12| CAC H 14| CGC R 12| C
C | CTA L 10| CCA P 14| CAA Q 18| CGA R  6| A
C | CTG L 24| CCG P 14| CAG Q 20| CGG R  6| G
--+---------+---------+---------+---------+--
A | ATT I 15| ACT T 15| AAT N 22| AGT S 13| T
A | ATC I 17| ACC T 12| AAC N 25| AGC S 13| C
A | ATA I 18| ACA T 16| AAA K 33| AGA R 13| A
A | ATG M 22| ACG T 12| AAG K 30| AGG R 10| G
--+---------+---------+---------+---------+--
G | GTT V 14| GCT A 19| GAT D 25| GGT G 13| T
G | GTC V 14| GCC A 18| GAC D 29| GGC G 19| C
G | GTA V 12| GCA A 13| GAA E 35| GGA G 14| A
G | GTG V 22| GCG A 19| GAG E 30| GGG G  8| G
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